Entra a el editor de directivas de grupo y ve a: Configuración del equipo > Plantillas administrativas > Componentes de Windows y haz clic sobre la carpeta «Windows Update» ahí entra en las propiedades de «Configurar actualizaci0nes automáticas».
Ahí puedes darle o a «habilitar» y poder configurarlo desde ahí, o puedes darle a «Deshabilitar».